免疫治疗
POLE
pembrolizumab
Title:Immune activation and response to pembrolizumab in POLE-mutant endome
Journal:The Journal of Clinical Investigation(JCI) JUNE 2016
IF:13
摘要
文章首先报道了一列PD-1抑制剂治疗获益的患者,对其原癌组织和转移癌组织进行测序,发现两个组织中都含有较高的突变负荷,且在两个组织的核酸外切酶区域都含有POLE突变。之后又选取了252个子宫内膜瘤患者进行测序,比较了POLE-mutation,MSI,MSS三种病人的突变负荷,检查点相关蛋白基因的表达、免疫细胞含量、及肿瘤浸润T细胞程度。结果表明,拥有POLE突变的病人更容易从PD-1抑制剂治疗中获益。
突变位点:POLE V411L (affects proofreading function)
一例现象:
文章首先报道了一例POLE突变的53岁女性子宫内膜癌患者,参加临床PD-1抑制剂的临床试验,取得了良好的效果。该患者具有家族肿瘤史:两个弟弟分别在55岁和67岁被诊断出了前列腺癌;父亲患脑癌在54岁离世;姨妈在54岁时被诊断出了结肠癌。在参加PD-1抑制剂临床试验之前,该患者先是进行了放疗,然后腹膜复发,随后又进行了化疗( doxorubicin, cisplatin, paclitaxel, and extended-field radiotherapy)。
A:该患者肿瘤旁的浸润T细胞比较明显 B:两年后,该患者得了supraclavicular adenopathy(锁骨上的腺病),检查后发现是肿瘤出现了转移
C:之后该患者参加了pembrolizumab药物的临床试验,结果取得了良好的效果 D:PD-1抑制剂治疗之后对该患者腹部和胸部进行了CT扫描,肿瘤块缩小(D); E:两组样品的体细胞突变。
原发癌组织和转移癌组织的基因组测序
取原发子宫内膜肿瘤和转移的锁骨淋巴瘤组织,用杂交捕获法(hybrid-capture–based)进行全面的基因组分析,测定了315个与肿瘤相关的基因,结果如下:
- 在原发癌组织样品中有32个序列变异被认为可能与致病相关,在转移癌组织样品中有33个序列变异与致病相关(两个组织的致病突变都异常高);
2.有28个在两个sample中都存在;且两组样品在exonuclease domain(核算外切酶区域)都存在POLE突变(POLE V411L, POLE R114*后者为无义突变)。POLE基因参与DNA复制,保证复制过程中DNA不发生突变,这位患者POLE基因出问题了,突变也多了
3.另外两个组织中还含有大量的意义不明的突变(VUS):116(primary)、159(recurrence),其中共有的有83个。 4.另外还有3个共有的胚系突变,但都意义不明;PTEN和其他致病性突变位点则都是体细胞突变;
作者根据这315个基因中的突变负荷来推算两个样品中整个基因组应该分别有4500和6500个非同义突变,还是很高。
252个子宫内膜留患者测序
作者又对252个子宫内膜瘤患者利用FoundationOne assay进行了基因检测,其中有23个人(9.1%)含有POLE突变,这些人当中致病突变和VUS(不明意义的突变)均值分别为21.2,82.2;POLE野生型的人群中则分别为7.5和12.8.(大约分别相差3倍和6倍),因此POLE突变很有可能引起高突变负荷。 然后作者又对TCGA里cancers的RNA-SEQ数据做了一个分析,结果发现。 A 非同义突变数:POLE-mutant>MSI>MSS B 免疫相关的基因表达量:POLE-mutant>MSI>MSS
A 编码checkpoint相关蛋白的基因(PD-L1,PD-L2,PD-1,CTAL-4,CG8A)表达量:POLE-mutant cancers>MSI>MSS
B 免疫细胞含量( CD8+ T cells, T follicular helper cells, M1 macrophages, and activated NK cells):POLE>MSI>MSS
C 肿瘤浸润T细胞程度:POLE>MSI>MSS
综上,作者认为拥有POLE突变的病人,突变负荷也越高,更容易从PD-1抑制剂治疗过程中获益。
####### 参考:http://www.360doc.com/content/17/0224/12/30276536_631641758.shtml
Author: 王英珍
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