TCR MIXCR

MIXCR：是一个分析TCR或BCR测序数据的工具(MiXCR is a universal software for fast and accurate analysis of T- and B- cell receptor repertoire sequencing data.)

这个软件的安装过程颇为不顺，但是现在看来都是一些小问题，依然折腾了大半天，因此决定将报错信息和解决办法记录下来。

软件地址：https://github.com/milaboratory/mixcr/releases/tag/v2.1.5

1. 下载mixcr-2.1.5.zip这个文件，解压，看到里边还有一个mixcr的软件包，再解压；
   解压之后的文件夹内必须包含mixcr.jar这个文件，如果没有后边执行的时候会报No jar.的错误！ 然后要改下mixcr这个文件的操作权限，要不然啊会报permision denied的错！

   chmod 755 mixcr

2. 运行java -version；看自己的java版本，必须高于1.8才可以；另外jre必须是64位的，要不然会报错：Invalid maximum heap size: -Xmx12000m！

如果出现以上java问题，重装JAVA，配置环境变量就可以解决问题。 64位java下载地址：https://www.java.com/zh_CN/download/manual.jsp

tar -xzvf jre-8u144-linux-x64.tar.gz
./bin/java -version

再次运行mixcr，perfect！

Author: 王英珍
qq: 296085360
email:wangyingzhen91@163.com